Identificação de proteínas exclusivas de fitopatógenos da família Xanthomonadaceae : uso de genômica comparativa para identificação de novos alvos de combate.
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Date
2016
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Abstract
A família Xanthomonadaceae compreende espécies diferentes de proteobactérias não patogênicas e patogênicas que infectam diferentes hospedeiros, incluindo humanos e plantas. Nesse estudo, foi realizado uma análise comparativa usando o genoma completo de 69 cepas bacterianas pertencentes à família Xanthomonadaceae com foco na identificação de famílias de proteínas exclusivas de fitopatógenos que poderiam justificar o estilo de vida e a capacidade desses microrganismos infectarem hospedeiros compatíveis. Foram identificadas sete famílias de proteínas fitopatógeno-específicas, todas supostamente secretadas pelo sistema secretório tipo II: PheA (CMs), LipA/LesA, VirK, e quatro famílias de proteínas envolvidas na degradação de N-glicanos, NixE, NixF, NixL e FucA1. Análises filogenéticas e in silico dessas famílias de proteínas revelaram que todas elas possuem ortólogos em outras bactérias simbióticas ou patogênicas de plantas e estão envolvidas na modulação e evasão do sistema imune. Uma vez que esse estudo inclui microrganismos estreitamente relacionados, com estilos de vida diferenciados e evidencia proteínas diretamente relacionadas com adaptação dentro dos tecidos vegetais, abordagens inovadoras podem ser implementadas visando não somente a utilização destas proteínas como alvos biotecnológicos para o controle da doença, mas também contribuindo para a nossa compreensão da coevolução de bactérias associadas a plantas.
Description
Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia. Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Pró-Reitoria de Pesquisa de Pós Graduação, Universidade Federal de Ouro Preto.
Keywords
Plantas - compostos bioativos, Bactérias fitopatogênicas, Genômica, Sistema imunológico, Coevolução
Citation
ASSIS, Renata de Almeida Barbosa. Identificação de proteínas exclusivas de fitopatógenos da família Xanthomonadaceae: uso de genômica comparativa para identificação de novos alvos de combate. 2016. 88 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) – Núcleo de Pesquisas em Ciências Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto, Ouro Preto, 2016.